Nuevo linaje de coronavirus descubierto en ciervos de Ontario

Los científicos han identificado una nueva versión altamente mutada coronavirus en venado de cola blanca en el suroeste de Ontario, uno que puede haber evolucionado en animales a fines de 2020.

También encontraron una secuencia viral muy similar en una persona local que tuvo contacto cercano con ciervos, la primera evidencia de una posible transmisión del virus de ciervo a humano.

«El virus está evolucionando en los ciervos y divergiendo en los ciervos, alejándose de lo que claramente vemos evolucionar en los humanos», dijo Samira Mubareka, viróloga del Instituto de Investigación Sunnybrook y la Universidad de Toronto y autora del nuevo artículo.

El informe aún no se ha publicado en una revista revisada por pares, y no hay evidencia de que el linaje de los ciervos se esté propagando o represente un alto riesgo para las personas. Los experimentos preliminares de laboratorio sugieren que es poco probable que el linaje escape a los anticuerpos humanos.

Pero el periódico se publicó en línea unos días después. Otro equipo informó que la variante Alfa pudo haber seguido propagándose y evolucionando en los ciervos de Pensilvania incluso después de su desaparición de las poblaciones humanas.

Juntos, los dos estudios sugieren que el virus podría circular entre los ciervos durante largos períodos de tiempo, lo que aumenta el riesgo de que eso suceda. los animales podrían convertirse en un reservorio a largo plazo del virus y fuente de futuras variantes.

«Ciertamente no hay necesidad de entrar en pánico», dijo Arinjay Banerjee, virólogo de la Universidad de Saskatchewan que no participó en ninguno de los estudios.

Pero, agregó, «cuantos más anfitriones tenga, más oportunidades tendrá el virus para evolucionar».

Estudios previos han encontrado esto el virus está muy extendido en venado cola blanca. La investigación sugiere que los humanos han introducido repetidamente el virus a los ciervos, que luego se lo transmiten entre sí. Cómo los humanos están transmitiendo el virus a los ciervos sigue siendo un misterio y hasta ahora no hay evidencia de que los animales lo estén transmitiendo a los humanos.

El estudio canadiense fue una colaboración que involucró a más de dos docenas de investigadores en instituciones de todo Ontario. Los científicos recolectaron hisopos nasales y muestras de tejido de ganglios linfáticos de 300 venados de cola blanca asesinados por cazadores en Ontario entre el 1 de noviembre y el 31 de diciembre de 2021. El seis por ciento de los animales, todos del suroeste de Ontario, dieron positivo por el virus, lo que sugiere que eran activamente infectados cuando morían.

Los investigadores secuenciaron el genoma viral completo de cinco ciervos infectados y encontraron una constelación única de mutaciones que no se habían documentado previamente. En general, 76 mutaciones, algunas de las cuales se habían encontrado previamente en ciervos, visones y otros animales infectados, distinguen el linaje de la versión original del virus.

Las muestras de ciervos estaban más estrechamente relacionadas con las muestras virales tomadas de pacientes humanos en Michigan, no lejos del suroeste de Ontario, en noviembre y diciembre de 2020. También eran similares a las muestras tomadas de humanos y visones en Michigan a principios de ese otoño.

Estos hallazgos, así como la velocidad a la que el virus acumula mutaciones, sugieren que el nuevo linaje puede haberse desviado de las versiones conocidas del virus y haber evolucionado sin ser notado desde finales de 2020.

Pero su ruta precisa no está clara. Una posibilidad es que los humanos hayan pasado el virus directamente a los ciervos y que el virus acumuló mutaciones a medida que se propagaba entre los ciervos. Alternativamente, el linaje puede haber evolucionado, al menos parcialmente, hacia otra especie intermedia, tal vez un visón de granja o salvaje, que luego de alguna manera lo transmitió a los ciervos.

«No tenemos todas las piezas del rompecabezas», dijo en un correo electrónico el Dr. Suresh Kuchipudi, microbiólogo veterinario de Penn State, que no participó en la investigación. “No podemos descartar la participación de un huésped intermedio”.

Una muestra viral recolectada de un paciente humano en el suroeste de Ontario en el otoño de 2021 coincidió estrechamente con las muestras de ciervos. Se sabe que esa persona tuvo «contacto cercano» con ciervos, dijeron los investigadores.

(No pudieron revelar más detalles sobre la naturaleza de este contacto por razones de privacidad, aunque el Dr. Mubareka señaló que las personas no deberían preocuparse por los encuentros accidentales e indirectos, como simplemente tener un ciervo deambulando por su jardín).

El tamaño de la muestra es pequeño, advierten los científicos, y no hay evidencia concluyente de que la persona haya contraído el virus del venado. «Todavía no tenemos suficiente información para confirmar esta transmisión a los humanos», dijo Roderick Gagne, ecólogo de enfermedades de la vida silvestre en la Facultad de Medicina Veterinaria de la Universidad de Pensilvania.

Pero en el momento de la recolección de muestras humanas, Ontario estaba secuenciando muestras del virus de todas las personas de la región que habían dado positivo en una prueba de PCR. Los investigadores no encontraron otras personas que hubieran sido infectadas con versiones similares del virus, por lo que es menos probable que haya evolucionado de forma independiente en humanos.

«Si hubiera circulado ampliamente entre los humanos, aunque solo fuera de forma limitada en los humanos, creo que lo habríamos detectado», dijo el Dr. Mubareka.

Además, no hay evidencia de que la persona infectada del linaje haya pasado el virus a otra persona.

Y los primeros datos sugieren que las vacunas existentes aún deberían poder proteger contra el linaje. Los científicos descubrieron que los anticuerpos de las personas vacunadas podían neutralizar los pseudovirus, virus inofensivos que no se replican, que fueron diseñados para parecerse al linaje de los ciervos.

En el segundo estudio, científicos de la Facultad de Medicina y Veterinaria de la Universidad de Pensilvania analizaron hisopos nasales de 93 ciervos que murieron en Pensilvania en el otoño y el invierno de 2021. El 19 por ciento estaba infectado activamente con el virus. Cuando los investigadores secuenciaron siete de las muestras, encontraron que cinco de los ciervos estaban infectados con la variante Delta, mientras que dos estaban infectados con Alpha.

En el momento de la recolección de muestras, Delta estaba muy extendido entre los humanos que residían en los Estados Unidos, pero la ola Alfa que afectó a los estadounidenses en la primavera de 2021 se había ido.

«Alfa parece persistir en los venados de cola blanca incluso durante el tiempo que no circula en los humanos», dijo Eman Anis, microbiólogo de la Facultad de Medicina Veterinaria de la Universidad de Pensilvania y autor del estudio.

De hecho, las muestras de Delta en ciervos eran genéticamente similares a las de los humanos, lo que sugiere que había cruzado líneas de especies relativamente recientemente. Pero las dos secuencias Alfa se habían separado más significativamente de los linajes humanos. (También eran sustancialmente diferentes entre sí, lo que sugiere que la variante se había introducido en la población de ciervos al menos dos veces).

«La principal implicación sería que los ciervos favorecen la transmisión y las infecciones dentro de sus poblaciones», dijo el Dr. Gagne, autor del estudio de Pensilvania. «Entonces, no es solo, ya sabes, un evento de recaída humana, los ciervos se infectan y luego desaparecen».

No se sabe si estos linajes seguirán circulando y evolucionando en los ciervos, así como el riesgo que pueden suponer para los humanos y otros animales.

«Según la información actual, diría que el riesgo de que la vida silvestre, incluidos los ciervos, transmita el virus a las personas es bajo», dijo Jeff Bowman, investigador del Ministerio de Desarrollo, Minas, Recursos Naturales y Forestales de Ontario y canadiense. autor del periódico.

Pero la vigilancia continua es clave, dijeron los científicos. El Dr. Mubareka sugirió que los funcionarios deberían mejorar la detección de aguas residuales en Ontario y otras regiones cercanas para buscar específicamente el linaje de los ciervos y asegurarse de que no se vuelva más frecuente.

Los expertos también instaron a las personas a seguir las pautas emitidas por las agencias de salud pública, que incluyen no alimentar a los ciervos u otros animales salvajes y usar guantes al sacrificar animales.

«También deberíamos reducir el reservorio más grande de este virus, que somos nosotros», dijo el Dr. Mubareka, «para asegurarnos de no extendernos continuamente a los ciervos y crear estos nuevos linajes».